Wissenschaftliche*n Mitarbeiter*in - Infektionsimmunologie und T-Zell-Erschöpfung (Postdoc) (m/w/d)

Die Stelleninhaberin/der Stelleninhaber (m/w/d) bearbeitet eigenständig ein wissenschaftliches Teilprojekt zur Differenzierung, Funktion und Regulation erschöpfter T-Zellen in chronischen Infektionen.

Die Stelle dient zugleich der eigenen wissenschaftlichen Qualifizierung. Sie ist auf hohe methodische Eigenständigkeit, publikationsfähige Ergebnisse und die fachliche Anleitung weniger erfahrener Mitglieder der Arbeitsgruppe ausgerichtet.

Eigenständige wissenschaftliche Bearbeitung des Teilprojekts:

• selbstständige Planung, Durchführung und Auswertung der Experimente des zugewiesenen Teilprojekts im Rahmen der mit der Arbeitsgruppenleitung abgestimmten Zielsetzung
• Entwicklung und Prüfung eigener Arbeitshypothesen zu Differenzierung, Aufrechterhaltung und Reversibilität der T-Zell-Erschöpfung
• zelluläre und molekulare Immunologie: Isolierung und Kultur primärer T-Zellen, adoptive Transfermodelle mit TCR-transgenen Zellen, Tetramer- und Multimerfärbungen, funktionelle Assays (Zytokinproduktion, Zytotoxizität, Proliferation, Restimulation)
• Multiparameter- und Spektralzytometrie einschließlich Panel-Design, Kompensation bzw. Entmischung und Zellsortierung
• Einsatz genetischer Werkzeuge in primären T-Zellen (retro-/lentivirale Transduktion, CRISPR/Cas-basierte Editierung), Knochenmarkchimären, konditionale Mausmodelle
• hochdimensionale Analysen: Einzelzell-Transkriptom- und TCR-Repertoire-Sequenzierung, Chromatin-Zugänglichkeits- und Bindungsanalysen, Probenvorbereitung und Qualitätssicherung

Tierexperimentelle Arbeiten und Infektionsmodelle:

• Durchführung der tierexperimentellen Arbeiten im Rahmen genehmigter Versuchsvorhaben und der eigenen Sachkunde nach § 16 TierSchVersV
• Arbeit mit Modellen akuter und chronischer Infektion ([z. B. LCMV Armstrong und clone 13, Listeria monocytogenes, VSV, Influenza, Tumormodelle]) einschließlich Infektion, Titerbestimmung und Verlaufskontrolle
• Belastungsbeurteilung anhand der festgelegten Score Sheets, Einhaltung der Abbruchkriterien und unverzügliche Meldung von Auffälligkeiten
• fachliche Zuarbeit zu Versuchsanträgen und Anzeigen nach §§ 8, 8a TierSchG einschließlich Tierzahlkalkulation und Umsetzung des 3R-Prinzips
• Abstimmung des Tierbedarfs mit dem Zuchtmanagement der Arbeitsgruppe
• Datenanalyse, Publikation und wissenschaftliche Kommunikation
• Auswertung und statistische Analyse der eigenen Daten, einschließlich der Analyse hochdimensionaler Datensätze mit geeigneten Werkzeugen ([R/Seurat, Python/scanpy, FlowJo/OMIQ])
• kritische Interpretation der Ergebnisse und Ableitung der nächsten Experimente
• Verfassen von Manuskripten in leitender Autorenschaft sowie Mitwirkung an Manuskripten der Arbeitsgruppe
• Vorträge und Posterbeiträge auf Fachtagungen, Präsentation in internen Seminaren und Journal Clubs
• Bereitstellung und Dokumentation der Daten nach den Regeln guter wissenschaftlicher Praxis und den FAIR-Grundsätzen einschließlich Hinterlegung in Fachrepositorien

Anleitung, Betreuung und Lehre:

• Fachliche Anleitung und Einarbeitung von Promovierenden, Studierenden und technischen Mitarbeitenden im Teilprojekt
• Fachliche Betreuung von Bachelor- und Masterarbeiten sowie Praktika; Mitwirkung in Thesis Advisory Committees
• Mitwirkung an Lehrveranstaltungen, insbesondere Methodenpraktika und Seminare
• Unterweisung neuer Mitarbeitender in Arbeitssicherheit, Biosicherheit und Tierschutz im eigenen Aufgabenbereich

Methodenetablierung, Labororganisation und Compliance:

• Etablierung, Validierung und Dokumentation neuer Methoden und Protokolle; Erstellung und Pflege von SOPs
• Verantwortung für zugeordnete Geräte, Reagenzien und Stammsammlungen einschließlich Bestellwesen im zugewiesenen Rahmen
• Einhaltung der Vorgaben zu Schutzstufe [1/2], Gentechnik, Biosicherheit und Entsorgung; Mitwirkung an Gefährdungsbeurteilungen
• Führung eines nachvollziehbaren Laborbuchs bzw. der elektronischen Dokumentation

Antragswesen und wissenschaftliche Vernetzung:

• Zuarbeit zu Förderanträgen und Berichten der Arbeitsgruppe; eigenständige Bewerbung um Stipendien und Eigenmittelprogramme zur wissenschaftlichen Qualifizierung
• Pflege der Kooperationen des Teilprojekts, Abstimmung von Materialtransfers und gemeinsamen Experimenten
• Peer Review nach Aufforderung sowie Mitwirkung an der Wissenschaftskommunikation der Einrichtung

Formale Voraussetzungen:

• abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master/Diplom) in Biologie, Biochemie, Biomedizin, Molekularer Medizin, Human- oder Veterinärmedizin oder einem verwandten Fach
• abgeschlossene oder unmittelbar bevorstehende Promotion mit immunologischem, infektionsbiologischem oder verwandtem Schwerpunkt
• Publikationen als Erstautorin/Erstautor in peer-reviewten Fachzeitschriften
• nachgewiesene Sachkunde nach § 16 TierSchVersV mit den Kenntnissen und Fähigkeiten nach Anlage 1 Abschnitt 3 (versuchstierkundlicher Kurs, z. B. FELASA-Funktion [A/B] oder gleichwertig)

Fachliche Kompetenzen

• vertiefte Kenntnisse der T-Zell-Biologie, insbesondere zu Differenzierung, Gedächtnisbildung und Erschöpfung (u. a. PD-1, TOX, TCF1, LAG-3, TIM-3; Progenitor- und terminal erschöpfte Subpopulationen)
• Erfahrung mit Modellen akuter und chronischer Infektion sowie mit adoptiven Transfersystemen und TCR-transgenen Mauslinien
• sichere Beherrschung der Multiparameter- bzw. Spektralzytometrie einschließlich Panel-Design und Zellsortierung
• Erfahrung mit mindestens einer hochdimensionalen Methode (Einzelzell-Transkriptomik, TCR-Repertoire-Analyse, Chromatin- oder Bindungsanalysen) und der zugehörigen Datenauswertung
• Kenntnisse in Biostatistik und Versuchsplanung; Fähigkeit zur eigenständigen Auswertung mit [R und/oder Python]
• Erfahrung im Umgang mit gentechnisch veränderten Organismen und biologischen Arbeitsstoffen der Schutzstufe [1/2]

Persönliche Kompetenzen

• hohe wissenschaftliche Eigenständigkeit bei gleichzeitiger Bereitschaft zur Abstimmung im Projektverbund
• Sorgfalt, Ausdauer und Verlässlichkeit in langlaufenden Infektions- und Tierversuchen
• Fähigkeit und Bereitschaft zur Anleitung weniger erfahrener Mitarbeitender
• Kooperations- und Kommunikationsfähigkeit im internationalen Team; verhandlungssichere Englischkenntnisse, Deutschkenntnisse [erforderlich / erwünscht]
• Verantwortungsbewusstsein im Umgang mit Versuchstieren und Belastbarkeit im tierexperimentellen Arbeiten

Die Stelle ist auf 36 Monate befristet zu besten. Mit einer internen Bewerbung wird gerechnet.

Interesse? Dann bewerben Sie sich gerne direkt über den Bewerbungsbutton online.

Prof. Dr. Dietmar Zehn

+49 8161 71 3508